В 2002 г. Марийский национальный театр им. М. Шкетана был реорганизован в Марийский национальный театр драмы им. М. Шкетана. Главным режиссером был назначен В.В. Домрачев. Созданный в 1991 г. Марийский ТЮЗ (Марий самырык театр) стал филиалом театра.
В 2003 г. Марийский национальный театр драмы им. М. Шкетана стал инициатором проведения республиканского конкурса на лучшее драматическое произведение.
Марийский Национальный театр им. М. Шкетана на рубеже веков представляет собой ищущий творческий коллектив, работы последних лет которого красноречиво свидетельствуют об отходе от традиций бытового театра, о стремлении, сохранив свое национальное и творческое своеобразие, включиться в мировой театральный процесс.